Летняя биоинформатическая школа Центра живых систем МФТИ

Даты проведения - с 5 по 9 августа, МФТИ, очно
О школе
Центр живых систем МФТИ приглашает принять участие в Летней биониформатической школе!

Летняя школа — отличная возможность познакомиться с новыми методами и технологиями, получить ценные знания, опыт и бесценный нетворкинг.

Школа продлится одну неделю с 5 по 9 августа. В первой половине дня будут читаться лекции, как совместные для всего потока, так и отдельно в рамках выбранного трека, во второй половине - будут проводиться занятия на отработку практики. Вам будет предложено решить конкретную задачу.

В этом году мы решили провести три трека:

  1. Мультиомика на уровне bulk и single cell
  2. Белковый дизайн
  3. Клиническая интерпретация данных NGS
Программа
школы
лекции&практика
Конкурсный отбор
обязателен для участия
Формат
очно, г. Долгопрудный, МФТИ
Стоимость
бесплатно
1.06 - 10.07.2024
1.06 - 10.07.2024
Регистрация на Летнюю школу
10.07-25.07.2024
10.07-25.07.2024
Отбор участников и финализация расписания
25.07.2024
25.07.2024
Рассылка (приглашение или отказ)
05.08-09.08.2024
05.08-09.08.2024
Проведение Летней школы

Центр живых систем МФТИ приглашает на лекцию про scRNA-seq на примере анализа данных нейробластом.
Данная лекция является вводной к треку 1 Мультиомика на уровне bulk и single cell Летней Биоинформатической школы Центра живых систем и будет посвящена анализу scRNA-seq данных на примере образцов эмбриональных надпочечников и нейробластом.
Лекция будет интересна для студентов старших курсов, недавних выпускников и молодых ученых. Будет плюсом, если вы уверенно владеете R или Python, а также базовыми знаниями о NGS.
Ждем интересующихся данной темой 9 июля в 15:00.
(МФТИ, г. Долгопрудный, Институтский переулок д.9, корпус Цифра, аудитория 5.18)
Лекцию проведет Антышева Зоя, м.н.с. лаборатории геномной инженерии, биоинформатик.

Регистрация обязательна (форма закроется в 12:00 8 июля)   https://forms.yandex.ru/cloud/667d0f9fe010db2643e00ee6/
Мультиомика на уровне bulk и single cell
Описание трека:
На данном треке на примере злокачественных опухолей будут показаны основные подходы в области анализа мультиомных данных на уровне bulk и single cell. Будет разобран анализ соматических и герминальных вариантов, анализ транскриптомных данных, анализ single cell транскриптомики и пространственной транскриптомики, анализ эпигенома. Будут объяснены методы машинного обучения, используемые для анализа мультиомных данных и составления предсказательных моделей на их основе.

Программа трека:
  • Single cell и пространственная транскриптомика
  • Bulk транскриптомика
  • Геномика, опухолевая геномика
  • Эпигеномика
  • Введение в машинное обучение
Задача для проработки на воркшопе
Выявление транскрипционных и генетических предикторов выживаемости пациентов с карциномой

Требования к участникам:
Мы будем рады видеть студентов старших курсов, недавних выпускников и молодых ученых. Для участие необходимо уверенное владение R или Python, а также базовые знания молекулярной биологии.
Расписание лекций и воркшопов является "рабочим", может быть изменено
Команда преподавателей
Команда преподавателей и приглашенных спикеров будет дополнена
  • Девяткин Андрей
    к.б.н., заведующий лаборатории вычислительных методов в биомедицине
  • Богданов Виктор
    к.х.н., заведующий лаборатории мультиомики, руководитель биоинформатических проектов
  • Максимов Денис
    аспирант, м.н.с. лаборатории геномной инженерии, биоинформатик, аналитик single-cell секвенирования
  • Альберт Евгений
    PhD ( TU Dresden, Германия), молекулярный биолог, руководитель биоинформатических проектов
  • Антышева Зоя
    научный сотрудник лаборатории геномной инженерии, руководитель биоинформатических проектов
  • Эсибов Антон
    исследователь лаборатории мультиомики
  • Андреева Нина
    исследователь лаборатории мультиомики
  • Рыжова Ольга
    организатор школы
Как это было два года назад
Часто задаваемые вопросы
Миша:
Даты проведения Летней школы?
Ответ:
С 5 по 9 августа в будни с понедельника по пятницу, суббота, воскресенье - выходные дни.
Катя:
Для кого организуется Летняя школа?
Ответ:
Мы ждем студентов старших курсов магистратуры биоинформатических специальностей, недавних выпускников, аспирантов, молодых ученых.
Илья
Для каких целей организуется Летняя школа?
Ответ:
Летняя школа проводится в целях реализации проекта "Сетевая программа развития кадрового потенциала в области разработки высокотехнологичных биологических лекарственных препаратов и анализа биомедицинских данных".
Леша:
Где территориально пройдет Летняя школа?
Ответ:
Московская область, г. Долгопрудный, Институтский переулок 9, стр.7, МФТИ
Аня:
Предоставляется ли общежитие?
Ответ:
Увы, нет. Все места в даты проведения Летней школы уже распределены. Мы предлагаем альтернативные варианты поселения за счет обучающихся https://phystech-hotel.ru/nomera, https://www.nethotel.ru/dolgoprudnyi.html
Денис:
Платное ли участие в Летней школе?
Ответ:
Участие бесплатное
Оля:
Получу ли я сертификат участника?
Ответ:
В конце мероприятия все участники школы получат на эл.почту, указанную при регистрации, цифровой сертификат, подтверждающий их участие
Центр живых систем
Адрес: Московская область, г.Долгопрудный, Институтский переулок, д.9, стр.7. Корпус Физтех.Био
edu@genlab.llc


Есть вопросы? Свяжитесь с нами!
Telegram
Mail
VK