3 места в аспирантуре в лаборатории
В 2022 году лаборатория геномной инженерии набирает трех аспирантов из числа поступающих на бюджетные места в МФТИ. Успешные кандидаты станут частью команды лаборатории и будут выполнять свои PhD проекты в рамках исследовательских проектов лаборатории.
Как подать заявку и поступить?
Лаборатория набирает аспирантов из числа поступающих в аспирантуру ФБМФ МФТИ на бюджетные места. Однако специфика наших проектов предполагает дополнительные этапы отбора, о них чуть ниже.

Общие правила приема в МФТИ опубликованы на сайте pk.mipt.ru.
Пожалуйста, ознакомьтесь с ними самостоятельно и не пропускайте общие дедлайны.
ОЗНАКОМИТЬСЯ С ПРАВИЛАМИ ПРИЕМА В МФТИ
Помимо общих правил приема, отбор в лабораторию состоит из четырех этапов. Одновременно с подачей заявления в МФТИ, кандидату необходимо обратиться напрямую в лабораторию, пройти интервью и стажировку.
1
Подайте заявку на PhD позицию
Заполните форму, отправьте CV и мотивационное письмо. На основании резюме и мотивационных писем мы отбираем кандидатов, которых приглашаем на интервью
2
Пройдите интервью с постдоками лаборатории
Интервью проходит в два этапа: быстрый звонок в зум и очное собеседование с командой лаборатории. На очном собеседовании вам потребуется сделать презентацию о вас, вашем опыте и предыдущих исследованиях
3
Пройдите стажировку в лаборатории
Каждый кандидат во время стажировки примет участие в трех проектах лаборатории. Для будущего аспиранта это возможность интегрироваться в команду, для лаборатории — проверить навыки и знания кандидата
4
Начните работу над диссертацией
По итогам стажировки, кандидат (совместно с будущим руководителем) выбирает научную группу, частью которой он станет, а также PhD проект, который будет делать следующие 4 года
О проектах и научных руководителях
Лаборатория геномной инженерии ориентирована на R&D проекты.
Мы относимся к аспирантам, как к самостоятельным членам нашей команды, ответственным за свою обособленную часть в рамках больших исследовательских проектов.

В 2022 году мы предлагаем несколько возможных PhD позиций в рамках проектов лаборатории. Успешный кандидат будет работать над одним из представленных ниже проектов под руководством постдока — научного сотрудника, ведущего проект, а также заведующего лабораторией.
Научный руководитель
Павел Волчков, к.б.н.
Директор Центра живых систем и биофарминжиниринга, заведующий лаборатории геномной инженерии МФТИ, Директор института персонализированной медицины ФГБУ "НМИЦ эндокринологии" Минздрава РФ.
Ученый-генетик мирового уровня, выпускник МГУ, работал в University of Chicago и Harvard Medical School. В научной деятельности специализируется на прикладных проектах в области генетики и биоинформатики для агро и биомедицины.
Научный руководитель
Павел Волчков, к.б.н.
Директор Центра живых систем и биофарминжиниринга, заведующий лаборатории геномной инженерии МФТИ, Директор института персонализированной медицины ФГБУ "НМИЦ эндокринологии" Минздрава РФ.
Ученый-генетик мирового уровня, выпускник МГУ, работал в University of Chicago и Harvard Medical School. В научной деятельности специализируется на прикладных проектах в области генетики и биоинформатики для агро и биомедицины.
Постдоки лаборатории
Непосредственные руководители аспирантов. Именно они руководят проектами, в рамках которых аспиранты будут делать свои диссертации, ежедневно общаются с аспирантами по их исследованиям, помогают достичь результата
Софья Феоктистова
Научные интересы: молекулярная биология, вирусология, биотехнология и создание препаратов на их основе
sayfutdinovas@gmail.com
Андрей Девяткин
к.б.н, научные интересы: эпидемиология вирусных заболеваний, эволюция и классификация вирусов, взаимодействие патогенов с организмом хозяина
andreideviatkin@gmail.com
Алексей Балдин
к.б.н., научные интересы: иммунология, онкоиммунология, противоопухолевые вакцины
alexeyvbaldin@gmail.com
Ксения Трутнева
к.б.н., научные интересы: разработка онковакцин для терапии различных видов рака эндокринных желез
trutneva-k@mail.ru
Проекты
Разработка новой системы доставки генетического материала на основе вирусных векторов
В рамках предлагаемого исследования будут проведены работы по созданию и изучению новых средств доставки генетического материала для геннотерапевтических и иммунопрофилактических приложений.
Предполагаемые этапы работы и задачи
- выбор кандидатных векторов;
- разработка системы обратной генетики для выбранного вектора;
- изучение сигнальных последовательностей, необходимых для упаковки нуклеиновых кислот;
- упаковка чужеродной последовательности нуклеиновых кислот в вирусный капсид;
- отработка протоколов доставки;
- изучение биологических свойств разработанных векторов.
Требования к кандидатам
- знание основных молекулярно-биологических методик: ПЦР, молекулярное клонирование;
- опыт работы с клетками млекопитающий: ведение клеточных культур, трасфекция, трансдукция, создание стабильных клеточных линий;
- опыт работы с первичным материалом;
- опыт работы с мелкими лабораторными животными;
- опыт написания научных статей и отчетов;
- желателен опыт самостоятельного ведения проектов.

Постдок — Софья Феоктистова
sayfutdinovas@gmail.com
Изучение филодинамики вируса гриппа для поиска рациональных стратегий борьбы с этой инфекцией
Вирус гриппа остается самым актуальным, но слабо охарактеризованным вирусным патогеном с т.з. вирусологии и эпидемиологии зоонозов. С одной стороны грипп циркуллирует в человеческой популяции, с другой — регулярно происходят заражения человека новым вариантом вируса от животных, в основном — птиц. Изучение филодинамики вируса гриппа необходимо для предсказания следующих патогенных штаммов, а также для разработки универсальных вакцин от данного заболевания.
Цели и задачи проекта
- оценка вклада событий рекомбинации/реассортации в эволюцию вируса гриппа;
- изучение возможности внедрения количественных критериев в таксономию вируса гриппа;
- пространственно-временное моделирование распространения отдельных вариантов вируса гриппа в мире.
Требования к кандидатам
- сильный теоретический базис в области биологии или математики, интерес к теме работы;
- умение читать англоязычную научную литературу, умение писать англоязычную научную литературу;
- уверенное программирование на R, bash или Python;
- опыт проведения базового биоинформатического анализа, например, построение выравниваний и филогенетических деревьев.

Постдок — Андрей Девяткин
andreideviatkin@gmail.com
Разработка терапии аутоиммунных заболеваний, путем индукции экспрессии специфических генов в тимусе для достижения желаемой антиген-специфичной толерантности
Проект направлен на изучение механизмов действия тимус-специфичных факторов транскрипции и на то, как можно манипулировать экспрессией генов в тимусе для достижения желаемой антиген-специфичной толерантности, что в дальнейшем может быть транслировано в клиническую практику как терапия аутоиммунных заболеваний.
Этапы работы и задачи
- секвенирование единичных тимоцитов мышей и человека;
- клонирование плазмидных конструкций, кодирующих AIRE, FEZF2, предполагаемых мотивов связывания AIRE и FEZF2, паратиреоидного гормона, инсулина и др. для дальнейшего репортерного анализа и конструирования AAV;
- AAV-опосредованная доставка трансгена в мышиные тимоциты;
- AIRE-зависимый сайленсинг генов с использованием подходов РНК интерференции и CRISPR-Cas13a системы;
- AIRE-зависимая индукция экспрессии;
- анализ мышиных иммунных клеток после тимус-специфического иммуноредактирования на наличие антиген-специфичного цитотоксического и/или супрессорного потенциала, секрецию цитокинов и т.д.
Требования к кандидатам
- магистратура в области биологии, мол. биологии, иммунологии;
- отличное знание иммунологии, опыт работы в иммунологии, онкоиммунологии или аутоиммунных заболеваний;
- ПЦР, вестерн-блоттинг, ИФА, ELISpot, экстракция НК, методы молекулярного клонирования, работу с клетками E. coli;
- работа с культурами эукариот, in vitro анализы и пробы (MTT, LDH и другие колориметрические и флуоресцентные анализы для определения жизнеспособности и пролиферации), трансфекция и трансдукция;
- работа с CRISPR/Cas;
- постановка внутримышечных инъекций мышам, забор органов;
- выделение первичными клетками человека и мыши;
- многоцветная проточная цитометрия, флуоресцентный клеточный сортинг, выделение клеток на основе магнитных шариков;
- анализ данных с помощью FlowJo, Graphpad Prism, и т.д.

Постдок — Алексей Балдин
alexeyvbaldin@gmail.com
Разработка терапии, предотвращающей матастазирование у пациентов с карциномой паращитовидной железы
Проект направлен на установление индукции иммунного ответа против специфических для метастаз карциномы паращитовидной железы с помощью вирус-основанной вакцины. Такое вмешательство может обеспечить терапевтический эффект в отношении злокачественных клеток у больных карциномой паращитовидной железы. Вакцинация против опухоль-специфичных антигенов может либо дополнять хирургию первичной опухоли для предотвращения рецидива заболевания, либо, при особых обстоятельствах, может рассматриваться даже как первичная терапия, если соответствующая опухоль неоперабельна.
Этапы работы и задачи
- секвенирование единичных тимоцитов мышей и человека;
- клонирование плазмидных конструкций, кодирующих AIRE, FEZF2, предполагаемых мотивов связывания AIRE и FEZF2, паратиреоидного гормона, инсулина и др. для дальнейшего репортерного анализа и конструирования AAV;
- AAV-опосредованная доставка трансгена в мышиные тимоциты;
- AIRE-зависимый сайленсинг генов с использованием подходов РНК интерференции и CRISPR-Cas13a системы;
- AIRE-зависимая индукция экспрессии;
- анализ мышиных иммунных клеток после тимус-специфического иммуноредактирования на наличие антиген-специфичного цитотоксического и/или супрессорного потенциала, секрецию цитокинов и т.д.
Требования к кандидатам
- магистратура в области биологии, мол. биологии, иммунологии;
- отличное знание иммунологии, опыт работы в иммунологии, онкоиммунологии или аутоиммунных заболеваний;
- ПЦР, вестерн-блоттинг, ИФА, ELISpot, экстракция НК, методы молекулярного клонирования, работу с клетками E. coli;
- работа с культурами эукариот, in vitro анализы и пробы (MTT, LDH и другие колориметрические и флуоресцентные анализы для определения жизнеспособности и пролиферации), трансфекция и трансдукция;
- работа с CRISPR/Cas;
- постановка внутримышечных инъекций мышам, забор органов;
- выделение первичными клетками человека и мыши;
- многоцветная проточная цитометрия, флуоресцентный клеточный сортинг, выделение клеток на основе магнитных шариков;
- анализ данных с помощью FlowJo, Graphpad Prism, и т.д.

Постдок — Ксения Трутнева
trutneva-k@mail.ru
Как податься?
Если вас вдохновляют проекты лаборатории, и вы хотите подать заявку в аспирантуру в нашей команде, пожалуйста, заполните форму ниже.
Если у вас остались вопросы
+7 (915) 377-11-07
genlabllc@gmail.com
Московская обл., Долгопрудный
Институтский переулок д.9 строение 7
МФТИ, корпус Физтех.Био
Контакты
  • +7 (915) 377-11-07
  • genlabllc@gmail.com
(с)
Genome Engineering Lab of MIPT,
since 2015